Nachdenk ich ja gestern den ganzen Tag mit den Sequenzen verbracht habe, würde jetzt schon gerne noch wissen, wie das Protein dazu auch aussieht. Eine Kristallstruktur ist leider noch nicht vorhanden, weshalb ich da mal nichts zu sagen kann. Glücklicherweise gibt es aber Programme/Websites, die mit der Seqeunz wenigstens die Sekundärstruktur vorhersagen können, also wo das Protein möglicherweise als Helix und wo als Faltblatt oder ganz und gar ungeordnet vorliegt. Würde es eine der erwähnten Kristallstrukturen zu einem ähnlichen Protein geben, könnte man sogar die Tertiärstruktur annähernd bestimmen. Gibt es aber leider nicht, somit muss mir die Sekundärstruktur reichen. Ich bin mal gespannt ob ich da Unterschiede erhalte, denn so anders sind die Proteine ja nicht, immerhin ist es ja alles IRT1, wenn auch aus unterschiedlichen Ökotypen. Mit einem ganz einfachen Programm, dass ich mal im 3. Semester für eine Übung geschrieben habe, hab ich schon herausgefunden, dass die Proteine alle mindestens acht Transmembranhelices haben, die auch noch an recht genau den gleichen Stellen liegen. Die Aminosäureaustausche haben also keine allzugroße Auswirkung. Mal sehn, was mir das tolle Programm vorhersagt, jetzt muss nur noch die Mail ankommen…